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JMT日本医疗——基因组信息+AI成功预测食管癌术前化疗效果②
作者:JMT日本医疗 时间:2022-08-29 10:07:40

炎症相关基因高表达组化疗效果高,中性粒细胞多组化疗效果低


为了从基因表达的程度来推断免疫细胞对癌细胞的作用,并研究与化疗效果的关系,研究人员从121个食管癌组织中获得了RNA表达分析数据并浸润到癌组织中。检测到的免疫细胞的活性。当研究人员对这些数据进行名为 GSEA 的分析以调查基因表达趋势时,研究人员发现各种炎症相关基因簇(如 IFN-γ)的活性,即通路(基因之间的连续功能关系)的活性在高化疗组。


此外,着眼于浸润食管癌组织的免疫细胞,研究人员能够将它们分为四组,其中中性粒细胞、B 细胞、CD8+ T 细胞和 CD4+ T 细胞大量表达。值得注意的是,中性粒细胞丰富组的化疗效果低于其他组,这表明中性粒细胞在功能上与化疗效果相关。因此,研究人员创建了一个保留免疫系统的鼠鳞状细胞癌模型,并证明中性粒细胞耗竭大大提高了化疗的疗效并抑制了肿瘤的生长。


使用机器学习开发化疗效果预测算法,AUC=0.8


接下来,整合121例的基因组突变信息、肿瘤免疫信息以及吸烟量、年龄、性别等临床信息等81条个体病例信息,利用机器学习预测化疗效果。算法到这种方法揭示了中性粒细胞浸润到肿瘤和肿瘤细胞拷贝数特征是对化疗疗效贡献最大的因素。


此外,为了检查所开发算法的诊断准确性,除了 121 例食管鳞状细胞癌新病例外,还对 20 例新病例进行了类似分析。结果,获得了表明诊断方法有用性的AUC = 0.8(越接近1,准确度越高)的值,证实了诊断准确度的再现性。


基于基因组和免疫信息的精准医疗期望


本研究证明,结合食管鳞状细胞癌组织的基因组信息、免疫信息、性别和生活方式等多种信息,可以预测化疗对食管癌的疗效。该研究方法不仅可以应用于食管癌,还可以应用于其他肿瘤的化疗效果预测和精准医疗。临床上,在事先诊断出术前化疗效果不理想的情况下,可以先行手术治疗。


研究人员还发现肿瘤免疫与化疗的效果密切相关。研究小组说:“我们将进一步详细研究免疫细胞对抗食管癌的活性,可能会导致化疗联合免疫检查点抑制剂或新的联合免疫疗法的发展。”


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